1、癌变，极有可能会发生恶性肿瘤，这样是尖锐湿疣最为严重的并发症之一，一旦治疗不及时极有可能会引起死亡。一旦感染后，如果治疗不及时，在将来很可能导致阴茎癌，宫颈癌等恶性肿瘤，这是比较严重的尖锐湿疣的危害。
2、溃疡症状，伴有偶尔的出血，随着病情的发展，病变部位可增大，逐渐增多，可引起局部的异物和不适感。由于发病的部位多在包皮内、尿道回、阴唇、阴道内、肛周等，这些部位容易受微生物感染，导致病变部位的溃疡、化脓、出血、疼痛和肿胀。
3、其他部位的尖锐湿疣病毒，可殃及任何发病部位，手足等，通过直接接触或被污染的物品的间接接触，可以导致眼结膜的乳头状瘤和口腔粘膜的乳头状瘤。